Schweitzer Fachinformationen
Wenn es um professionelles Wissen geht, ist Schweitzer Fachinformationen wegweisend. Kunden aus Recht und Beratung sowie Unternehmen, öffentliche Verwaltungen und Bibliotheken erhalten komplette Lösungen zum Beschaffen, Verwalten und Nutzen von digitalen und gedruckten Medien.
Title
Introduction
What This Book Does for You
Foolish Assumptions
How This Book Is Organized
Icons Used in This Book
Where to Go from Here
Part I : Getting Started in Bioinformatics
Chapter 1: Finding Out What Bioinformatics Can Do for You
What Is Bioinformatics?
Analyzing Protein Sequences
Analyzing DNA Sequences
Analyzing RNA Sequences
DNA Coding Regions: Pretending to Work with Protein Sequences
Working with Entire Genomes
Chapter 2: How Most People Use Bioinformatics
Becoming an Instant Expert with PubMed/Medline
Retrieving Protein Sequences
Retrieving DNA Sequences
Using BLAST to Compare My Protein Sequence to Other Protein Sequences
Making a Multiple Protein Sequence Alignment with ClustalW
Part II : A Survival Guide to Bioinformatics
Chapter 3: Using Nucleotide Sequence Databases
Reading into Genes and Genomes
Making Use (and Sense) of GenBank
Using a Gene-Centric Database
Working with Whole-Genome Databases
Exploring the Human Genome
Chapter 4: Using Protein and Specialized Sequence Databases
From Translated ORFs to Mature Proteins
Reading a Swiss-Prot Entry
Finding Out More about Your Protein
Chapter 5: Working with a Single DNA Sequence
Catching Errors Before It's Too Late
Computing/Verifying a Restriction Map
Designing PCR Primers
Analyzing DNA Composition
Finding Protein-Coding Regions
Assembling Sequence Fragments
Beyond This Chapter
Chapter 6: Working with a Single Protein Sequence
Doing Biochemistry on a Computer
Doing Primary Structure Analysis
Predicting Post-Translational Modifications in Your Protein
Finding Known Domains in Your Protein
Discovering New Domains in Your Proteins
More Protein Analysis for Free over the Internet
Part III : Becoming a Pro in Sequence Analysis
Chapter 7: Similarity Searches on Sequence Databases
Understanding the Importance of Similarity
The Most Popular Data-Mining Tool Ever: BLAST
Controlling BLAST: Choosing the Right Parameters
Making BLAST Iterative with PSI-BLAST
Similarity Searches for Free over the Internet
Chapter 8: Comparing Two Sequences
Making Sure You Have the Right Sequences and the Right Methods
Making a Dot Plot
Making Local Alignments over the Internet
Making Global Alignments over the Internet
Using Lalign to Make a Global Alignment
Aligning Proteins and DNA
Free Pairwise Sequence Comparisons over the Internet
...
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