Bioinformatica Estrutural

O projeto Genoma do Schistosoma mansoni veio trazer grandes expectativas no combate às doenças tropicais negligenciadas. Estima-se que o genoma do esquistossomo possua cerca de 13.000 genes que codificam proteínas. No entanto, a função de maior parte destas proteínas ainda não foi compreendida. Para identificar os alvos mais promissores para o desenvolvimento de medicamentos, o proteoma do Schistosoma mansoni foi comparado com o genoma de 2 organismos com filogenia próxima (Caenorhabdits elegans e Drosophila melanogaster), buscando proteínas com semelhança estrutural que desempenhem funções vitais. A seguir, foram identificados potenciais ligantes na biblioteca de compostos do banco de dados Zinc Database por meio de técnicas de docking. O Zinc possui 100 milhões de compostos. Os testes de docking foram realizados com auxílio da parceria com a World Community Grid (http://www.worldcommunitygrid.org/research/sn2s/overview.do), que utiliza a capacidade ociosa de computadores pessoais em todo o mundo, criando um supercomputador virtual para uso em tarefas de interesse global.