Calcul parallèle avec R
1st Edition
Published on 28. June 2016
130 pages
978-2-7598-2068-9 (ISBN)
Description
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More details
Persons
Miele Vincent:
Vincent Miele est Ingénieur de recherche au CNRS au sein du laboratoire Biométrie et biologie évolutive, spécialiste de l'algorithmique, du calcul parallèle et de la programmation en R et en C++.
Louvet Violaine:
Violaine Louvet est Ingénieure de recherche au CNRS, co-fondatrice du groupe Calcul, spécialiste du calcul scientifique intensif et des architectures parallèles et Directrice du GRICAD (Grenoble Alpes Recherche - Infrastructure de Calcul Intensif et de Données).
Vincent Miele est Ingénieur de recherche au CNRS au sein du laboratoire Biométrie et biologie évolutive, spécialiste de l'algorithmique, du calcul parallèle et de la programmation en R et en C++.
Louvet Violaine:
Violaine Louvet est Ingénieure de recherche au CNRS, co-fondatrice du groupe Calcul, spécialiste du calcul scientifique intensif et des architectures parallèles et Directrice du GRICAD (Grenoble Alpes Recherche - Infrastructure de Calcul Intensif et de Données).
Content
- Calcul parallèle avec R
- Comité éditorial
- Remerciements
- Préface
- Table des matières
- 1. A la recherche de performances
- 1.1 L'organisation de projet
- 1.2 Les différentes approches en R pour gagner en performances
- 2. Fondamentaux du calcul parallèle
- 2.1 Évolution des ordinateurs et nécessité du calcul parallèle
- 2.2 Les architectures parallèles
- 2.3 Le calcul parallèle
- 2.4 Limites aux performances
- 3. Calcul parallèle avec R sur machine multi-coeurs
- 3.1 Principe général
- 3.2 Le package parallel et son utilisation
- 3.3 L'équilibrage de charge
- 4. Calcul parallèle dans C++ interfacé avec R sur machine multi-coeurs
- 4.1 Principe général
- 4.2 openMP
- 4.3 Les threads de C++11
- 4.4 RcppParallel
- 5. Calculs et données distribués avec R sur un cluster
- 5.1 Cluster orienté HPC
- 5.2 Cluster orienté big data
- Annexe A. Notions complémentaires
- A.1 Problématique du calcul flottant
- A.2 La complexité
- A.3 Typologie des langages
- A.4 Les accélérateurs
- A.5 Exemples d'utilisation de Rcpp avec la fonction cppfunction du package inline
- Bibliographie
- Index
