Vida.exe
Desafíos y aventuras de la bioinformática
1st Edition
Published on 30. May 2022
176 pages
978-987-719-226-1 (ISBN)
Description
¿De qué modo la computación y la informática ampliaron y modificaron los conocimientos sobre las ciencias de la vida? ¿La bioinformática representa realmente una ruptura de paradigmas o es más de lo mismo con otro formato? ¿La matemática puede ayudarnos a entender cómo se propaga una epidemia y qué medidas se pueden tomar para detenerla? ¿El Proyecto Genoma Humano fue el fin de algo o apenas el principio? ¿El ser humano puede crear vida artificial? ¿Es posible diseñarla a través de una computadora? ¿Seremos eternos e inmortales con cuerpos artificiales y mentes digitales?
En Vida.exe, un grupo de jóvenes científicas y científicos cuentan cómo la revolución tecnológica impactó en la biología, explican el pasado de ese extraño centauro que es la bioinformática y lo usan de excusa para dar cuenta de cómo se trabaja actualmente desde la ciencia para intentar descifrar los enigmas de la vida.
"Cuando contamos con suficiente información, no solo somos capaces de entender bastante sobre el funcionamiento de las moléculas, las células, los organismos y sus comunidades, sino también de predecirlo y replicarlo. Esto abre la puerta a prácticas que hace veinte años parecían de ciencia ficción, pero hoy son muy reales, como la biología sintética, la edición de genomas y la medicina personalizada. En un futuro muy próximo, la forma en que entenderemos la biología molecular, la agricultura y gran parte de la medicina estará inexorablemente atravesada por la bioinformática."
Entender cómo funcionan los seres vivos no solo es un fin en sí mismo, sino también una herramienta para mejorar nuestra vida y la de todas las especies que habitan el planeta.
More details
Persons
Germán A. González es licenciado en Bioinformática por la Universidad Nacional de Entre Ríos (UNER) y maestrando en Estadística Aplicada en la Universidad Nacional de Córdoba. Se desempeña como profesor adjunto del Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Conicet). Se dedica al análisis de datos biológicos en diferentes escalas, desde lo molecular a lo ecológico.
Lionel Uran Landaburu es licenciado en Biotecnología y actualmente realiza su doctorado en el Laboratorio de Genómica y Bioinformática de Trypanosomátidos de la Universidad Nacional de San Martín, en el desarrollo de software para asistir al descubrimiento y la optimización de drogas para el tratamiento de distintas enfermedades infecciosas.
Nicolás Palopoli es licenciado en Biotecnología y doctor en Ciencias Básicas y Aplicadas por la Universidad Nacional de Quilmes (UNQ). Es docente universitario e investigador adjunto del CONICET. Se dedica al estudio de estructuras, interacciones y evolución de proteínas.
Martín Banchero es licenciado en Ciencias Biológicas por la Universidad de Buenos Aires (UBA) y magíster en Bioinformática y Biología de Sistemas por la UVA-VU Amsterdam. Actualmente realiza su doctorado en el campo de la inmunología sistémica.
Juan Pablo Bustamante es licenciado en Bioinformática por la UNER en el área de Química Biológica. Trabajó dos años en la empresa uBiome. Es profesor de la UNER y de la Universidad Austral e investigador asistente del CONICET. Lidera un equipo de investigación y desarrollo en el análisis de microbiomas humanos.
Esteban Lanzarotti es licenciado en Ciencias de la Computación y doctor en Química Biológica por la UBA. Actualmente es investigador posdoctoral en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (Heidelberg, Alemania). Su experiencia incluye varias ramas de la bioinformática, como la regulación transcripcional, el plegado de proteínas y la transcriptomática de célula única.
María Victoria Revuelta es licenciada y doctora en Ciencias Biológicas por la Universidad de Mar del Plata (UNMDP). Es investigadora posdoctoral en Weill Cornell Medicine (Nueva York) y actualmente trabaja en el análisis de datos de metabolómica, transcriptómica y epigenómica en tumores hematológicos.
Nicolás Stocchi es licenciado en Ciencias Biológicas y doctorando en Biología por la UNMDP. Actualmente, es becario doctoral del Conicet. Se dedica al desarrollo de software para la anotación de superfamilias de proteínas y proteomas completos.
Elin Teppa es licenciada en Biotecnología y Doctora en Ciencias Básicas y Aplicadas por la UNQ, y se convirtió en bioinformática durante el doctorado en el Instituto Leloir. Es investigadora del Conicet. Se dedica a estudiar evolución molecular y cómo los virus se hacen resistentes a las drogas.
Diego Javier Zea es licenciado en Biotecnología y doctor en Ciencias Básicas y Aplicadas por la UNQ. Actualmente, es investigador posdoctoral en la Universidad de la Sorbona, Francia. Se dedica al estudio de la evolución y la estructura de proteínas.
Lionel Uran Landaburu es licenciado en Biotecnología y actualmente realiza su doctorado en el Laboratorio de Genómica y Bioinformática de Trypanosomátidos de la Universidad Nacional de San Martín, en el desarrollo de software para asistir al descubrimiento y la optimización de drogas para el tratamiento de distintas enfermedades infecciosas.
Nicolás Palopoli es licenciado en Biotecnología y doctor en Ciencias Básicas y Aplicadas por la Universidad Nacional de Quilmes (UNQ). Es docente universitario e investigador adjunto del CONICET. Se dedica al estudio de estructuras, interacciones y evolución de proteínas.
Martín Banchero es licenciado en Ciencias Biológicas por la Universidad de Buenos Aires (UBA) y magíster en Bioinformática y Biología de Sistemas por la UVA-VU Amsterdam. Actualmente realiza su doctorado en el campo de la inmunología sistémica.
Juan Pablo Bustamante es licenciado en Bioinformática por la UNER en el área de Química Biológica. Trabajó dos años en la empresa uBiome. Es profesor de la UNER y de la Universidad Austral e investigador asistente del CONICET. Lidera un equipo de investigación y desarrollo en el análisis de microbiomas humanos.
Esteban Lanzarotti es licenciado en Ciencias de la Computación y doctor en Química Biológica por la UBA. Actualmente es investigador posdoctoral en el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (Heidelberg, Alemania). Su experiencia incluye varias ramas de la bioinformática, como la regulación transcripcional, el plegado de proteínas y la transcriptomática de célula única.
María Victoria Revuelta es licenciada y doctora en Ciencias Biológicas por la Universidad de Mar del Plata (UNMDP). Es investigadora posdoctoral en Weill Cornell Medicine (Nueva York) y actualmente trabaja en el análisis de datos de metabolómica, transcriptómica y epigenómica en tumores hematológicos.
Nicolás Stocchi es licenciado en Ciencias Biológicas y doctorando en Biología por la UNMDP. Actualmente, es becario doctoral del Conicet. Se dedica al desarrollo de software para la anotación de superfamilias de proteínas y proteomas completos.
Elin Teppa es licenciada en Biotecnología y Doctora en Ciencias Básicas y Aplicadas por la UNQ, y se convirtió en bioinformática durante el doctorado en el Instituto Leloir. Es investigadora del Conicet. Se dedica a estudiar evolución molecular y cómo los virus se hacen resistentes a las drogas.
Diego Javier Zea es licenciado en Biotecnología y doctor en Ciencias Básicas y Aplicadas por la UNQ. Actualmente, es investigador posdoctoral en la Universidad de la Sorbona, Francia. Se dedica al estudio de la evolución y la estructura de proteínas.
Content
- Intro
- Portada
- Sobre este libro
- Sobre los autores
- Agradecimientos
- Prólogo
- I. Sopa de letras, por Germán A. González
- Los ladrillos de la vida
- Época de cambios
- Destapar la doble hélice
- Del adn a las proteínas
- Estudiar las proteínas
- El atlas de Maggie
- El problema de comparar secuencias
- Las secuencias nos dan una clase sobre evolución
- II. Guía para escalar una montaña de datos, por Germán A. González
- La revolución del software libre
- La aldea global
- Relojes, chocolates y proteínas
- Del otro lado del charco
- La bioinformática en el Proyecto. Genoma Humano
- La secuenciación se hace masiva
- Dónde estamos y hacia dónde vamos
- III. El árbol de la vida, por Germán A. González, Nicolás Stocchi y María Victoria Revuelta
- Malentendidos de la evolución
- De polillas y otros bichos
- Clasificar la vida
- Nos fuimos por las ramas
- Armar el arbolito
- La era del adn
- El detective evolutivo
- Una mirada global
- Es la evolución, nena
- IV. La vida secreta de las moléculas, por Juan Pablo Bustamante, R. Gonzalo Parra y Nicolás Palopoli
- La clase obrera
- Calcular en grande
- La danza molecular
- Sácala a bailar
- Del modelo al laboratorio
- V. El mundo es un pañuelo, por Diego Javier Zea
- Redes de mundo pequeño
- ¿Podrá Roberto Carlos tener un millón de amigos?
- La vida en red
- Proteínas sociales
- Todos para uno y uno para todos
- Fortalezas y debilidades de vivir en un pañuelo
- VI. Sobre gallinas y engranajes, por R. Gonzalo Parra, Juan Pablo Bustamante y Nicolás Palopoli
- De máquinas y autómatas
- El juego de la vida
- Fronteras de una prisión infinita
- Una vista panorámica
- Si aún te queda algo de amor
- Los muertos vivientes
- VII. ¿Big bang? No, Bio bang, por Esteban Lanzarotti, Lionel Uran Landaburu y Martín Banchero
- Imitar la biología
- Un gusanito muy simpático
- Repensar la vida a partir de la vida
- Aprender haciendo
- Programar biología: BioBricks
- Biotecnología sintética
- Una parada bioética
- VIII. Diseñado para vos, por Germán A. González
- Una letra puede hacer la diferencia
- Editar el genoma
- Hecho a medida
- Un futuro no tan lejano
- IX. El genoma después del genoma, por Germán A. González y R. Gonzalo Parra
- Cada célula importa
- El atlas de la vida
- No estamos solos ni aun solos
- Moldeados por el ambiente
- Huellas en nuestros genes
- La herencia que no está en los genes
- X. El poder de las masas, por Elin Teppa
- Muchas cabezas piensan más que dos
- Desencuentros del tercer tipo
- Pretty proteína
- Alíneate un poco, por favor
- Un minuto de juego contra la malaria
- arn diseñados por humanos y evaluados por la naturaleza
- XI. El rey desnudo y sin corona (virus), por Germán A. González
- ¿Qué es un virus?
- ¿Cuántas especies de virus hay?
- Los coronavirus
- Conociéndote
- A mutar, mi amor
- ¿Natural o diseñado?
- Dar la batalla
- La matemática al rescate
- El fin de la pandemia
- Epílogo
- Créditos
